Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ParnQ8VDG3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ParnQ8VDG3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ParnQ8VDG3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms