Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap2Q8VC34 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap2Q8VC34 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms