Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shtn1Q8K2Q9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shtn1Q8K2Q9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms