Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spire2Q8K1S6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spire2Q8K1S6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spire2Q8K1S6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms