Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp27Q8CEG8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp27Q8CEG8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp27Q8CEG8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp27Q8CEG8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp27Q8CEG8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Usp27Q8CEG8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Usp27Q8CEG8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms