Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc15Q8C9M2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc15Q8C9M2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms