Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930507D05RikQ8C9C9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms