Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmnQ8C5W0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmnQ8C5W0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms