Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn17Q8BXA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn17Q8BXA6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Cldn17Q8BXA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn17Q8BXA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms