Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ankrd55Q8BLD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms