Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop53Q8BK35 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop53Q8BK35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop53Q8BK35 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms