Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M10.6Q85ZW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms