Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgo2Q7TSY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo2Q7TSY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms