Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc93Q7TQK5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc93Q7TQK5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms