Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GmipQ6PGG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GmipQ6PGG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GmipQ6PGG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms