Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm29Q6PDI5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm29Q6PDI5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm29Q6PDI5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms