Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb40Q6PCS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb40Q6PCS8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms