Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc4Q6P2L7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Casc4Q6P2L7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casc4Q6P2L7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms