Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Szrd1Q6NXN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Szrd1Q6NXN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms