Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr44Q6NVE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms