Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2surpQ6NV83 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms