Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg9aQ68FE2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg9aQ68FE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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