Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp9cQ66X01 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp9cQ66X01 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlrp9cQ66X01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp9cQ66X01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms