Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Knl1Q66JQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Knl1Q66JQ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Knl1Q66JQ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms