Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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Clcn1Q64347 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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Clcn1Q64347 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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Clcn1Q64347 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn1Q64347 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn1Q64347 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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