Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic3Q62521 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic3Q62521 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms