Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SrmsQ62270 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrmsQ62270 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms