Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim25Q61510 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim25Q61510 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim25Q61510 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms