Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mre11Q61216 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mre11Q61216 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mre11Q61216 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms