Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkrn3Q60764 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mkrn3Q60764 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mkrn3Q60764 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms