Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim58Q5NCC9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim58Q5NCC9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms