Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc2Q56A06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc2Q56A06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms