Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam228bQ497Q6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam228bQ497Q6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam228bQ497Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms