Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain3Q3URJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms