Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec31aQ3UPL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec31aQ3UPL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec31aQ3UPL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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