Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A930003A15RikQ3U552 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A930003A15RikQ3U552 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms