Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LcorlQ3U285 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LcorlQ3U285 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms