Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy4Q3TYX8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy4Q3TYX8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms