Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc10Q3TLI0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc10Q3TLI0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc10Q3TLI0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms