Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrx1Q3TL44 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrx1Q3TL44 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms