Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ptchd1Q14B62 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ptchd1Q14B62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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ptchd1Q14B62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ptchd1Q14B62 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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ptchd1Q14B62 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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ptchd1Q14B62 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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ptchd1Q14B62 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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ptchd1Q14B62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms