Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h18Q0P678 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h18Q0P678 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms