Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 935.2 ms