Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MestQ07646 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MestQ07646 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MestQ07646 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MestQ07646 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MestQ07646 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MestQ07646 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MestQ07646 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MestQ07646 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MestQ07646 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MestQ07646 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MestQ07646 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MestQ07646 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MestQ07646 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MestQ07646 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MestQ07646 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MestQ07646 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MestQ07646 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MestQ07646 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MestQ07646 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MestQ07646 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MestQ07646 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MestQ07646 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MestQ07646 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MestQ07646 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms