Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah2Q06986 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah2Q06986 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms