Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pfdn6Q03958 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms