Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms