Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VldlrP98156 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VldlrP98156 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VldlrP98156 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VldlrP98156 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VldlrP98156 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms