Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1bP97358 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf1bP97358 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1bP97358 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms