Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frat1P70339 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frat1P70339 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frat1P70339 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frat1P70339 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frat1P70339 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms